A partir de 1991 la Universidad Autónoma de Aguascalientes tomó en sus manos la organización de las Olimpiadas a través del Departamento de Apoyo a la Investigación y la colaboración de los delegados de cada una de las áreas participantes; desarrollando actividades tales como la difusión, organización de concursos estatales, ceremonias de premiación, preparación de estudiantes para el concurso nacional y gestión de recursos otorgados principalmente por Gobierno de Estado.

En cuanto a los delegados, su responsabilidad es participar en la planeación de las Olimpiadas, elaborar el examen del concurso estatal, aplicarlo, revisar los exámenes e informar los resultados a la coordinación general, además de elaborar el programa de los cursos de capacitación tanto para estudiantes que integran la delegación estatal como para los profesores de las instituciones de educación media que desean participar como asesores. Coordinar las actividades necesarias para la realización de los cursos, participar como capacitador, así como apoyar en las actividades de difusión del concurso estatal y en los trámites de lo estudiantes son otras de las funciones de los delegados.